وقد تولى قيادة الجامعة منذ إنشائها المدراء التالية أسماؤهم:

· معالي الدكتور / عبد الوهاب بن محمد حسن عزام من 14/4/1377هـ إلى 8/7/1378هـ

· معالي الشيخ / ناصر بن عبد العزيز المنقور من 12/7/1378هـ إلى 3/7/1380هـ.

· معالي الدكتور / عبد العزيز بن محمد الخويطر من 1381هـ إلى 1391هـ

· معالي الدكتور / عبد العزيز بن عبد الله الفدا من 1391هـ إلى 6/2/1399هـ

· معالي الدكتور / منصور بن إبراهيم التركي من 7/2/1399هـ إلى 12/8/1410هـ

· معالي الدكتور / أحمد بن محمد الضبيب من 13/8/1410هـ إلى 2/3/1416هـ

· معالي الدكتور / عبد الله بن محمد الفيصل من 3/3/1416هـ إلى 2/3/1428هـ

· معالي الدكتور / عبد الله بن عبد الرحمن العثمان من 3/3/1428هـ وحتى الآن